Aktif kullanımda olan dosyalar hariç her şeyi sildiğinizi düşünüyorum. Orada birçok uygulamanın kendisi için klasörleri ekleniyor ve yedeğiniz varsa oradan dönersiniz yok ise yeniden kurulum daha az zaman kaybı olabilir. Geri yükleme denediniz mi? Harici yedek var mı?