M2_0 yok, M2_1'dir o. 1, 2, 3, 4 diye gidiyor.
M2_2 zaten paylaşımlı. Taktığınız an (veya iptal etmek için BIOS'tan ayarı vardır) PCI_E1 portu x8, M2_2 portu x4 hızında çalışıyor. SSD'lerin hepsi zaten x4, direkt olarak etkilemesi beklenmez.
Şimdi vadedilen hız 7450 / 6900 iken birisinin 7466 / 6967, diğerinin 6582 / 6438 olması "sorun" değil mi? Sadece önceki cümleye bakarak bir sorun olduğunu ben de düşünüyorum... ta ki son mesajınızı görene kadar.
Literatürde var mı bilmiyorum ama chipset üzerinden yapılan bağlantıda bu tarz bir düşüş görmek bana şaşırtıcı gelmiyor. Test amaçlı ekran kartını PCI_E3 portuna takıp PCI_E1 ve PCI_E2 slotlarını boş bırakarak 990 PRO'lardan birini M2_2 slotuna takmayı deneyebilirsiniz. O senaryoda M2_1 ve M2_2 portlarındaki 990 PRO'lardan yeterince yakın performans alıyorsanız chipset suçlanabilir.
Keza 990 PRO'ları M2_3 ve M2_4 portlarına takıp kıyaslayabilirsiniz. O durumda ikisi de chipset üzerinden bağlanmış olur.